Robert Neil Gerard Miller

Formação

• Pós-Doutorado - Periodo: 1997 a 1999 - Embrapa Hortaliças
• Pós-Doutorado - Periodo: 2005 a 2006 - Centre de coop inter en recherche agronomique pour le développement
• Doutorado - Periodo: 1992 a 1995 - Biologia Molecular e Fitopatologia
  University Of Reading
• Mestrado - Periodo: 1990 a 1991 - Proteção de Plantas
  University Of Bath
• Graduação - Periodo: 1986 a 1990 - Applied Biological Sciences
  Manchester Metropolitan University

Atuação Profissional

• Acta Horticulturae- / Periodo: 2007 a atual
• Anais da Academia Brasileira de Ciências (Impresso)- / Periodo: 2014 a atual
• Annals of Botany (Print)- / Periodo: 2011 a atual
• Bill and Melinda Gates Foundation- / Periodo: 2014 a atual
• Biologia Plantarum (Praha)- / Periodo: 2012 a atual
• BMC Genomics- / Periodo: 2013 a atual
• Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico- / Periodo: 2011 a atual
• Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior- / Periodo: 2014 a atual
• Crop Science- / Periodo: 2014 a atual
• Diagene Diagnosticos Moleculares Ltda- / Periodo: 2004 a 2008
• Electronic Journal of Biotechnology- / Periodo: 2014 a atual
• Embrapa Hortaliças- / Periodo: 1997 a 1999
• Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária- / Periodo: 2000 a 2002
• Euphytica (Wageningen)- / Periodo: 2010 a atual
• Fitopatologia Brasileira- / Periodo: 2000 a atual
• International Journal of Plant Genomics- / Periodo: 2007 a atual
• International Mycological Institute- / Periodo: 1991 a 1997
• Molecular Plant Pathology- / Periodo: 2009 a atual
• Mycopathologia (Online)- / Periodo: 2002 a atual
• Revista de Ciencias Agronomicas- / Periodo: 2007 a atual
• Tropical Plant Pathology- / Periodo: 2013 a atual
• Universidade Católica de Brasília-UCB / Periodo: 2000 a 2008
• Universidade de Brasília-UNB / Periodo: 2009 a atual
• Universidade de Brasília-UNB / Periodo: 2008 a 2009
• Universidade de Brasília-UNB / Periodo: 1999 a 2000

Linha de Pesquisa

• Caracterização e diagnose molecular de microrganismos
• Genoma funcional de microrganismos
• Interação planta-praga - a busca de genes de resistência a estresse biotico em plantas

Projetos de Pesquisa

• CNPq Rede EstRESCe: Projeto integrativo 1: Bioprospecção e análise integrativa dos dados
  Edital MCT/CNPq/FNDCT/FAPs/MEC/CAPES/PRO-CENTRO-OESTE nº 31/2010
  Período: 2010 - atual / Situação: EM_ANDAMENTO / Natureza: PESQUISA
• Pronex - NÚCLEO DE EXCELÊNCIA EM BIOPROSPECÇão DE ENZIMAS INDUSTRIAIS : ESTUDOS DO POTENCIAL LIGNOCELULOLÍTICO DE FUNGOS E BACTÉRIAS ANAERÓBICAS CRESCIDOS EM RESÍDUOS AGRO-INDUSTRIAIS
  O objetivo do presente projeto é o caracterizar molecularmente o secretoma de fungos filamentosos quando crescidos em resíduos agro-industriais, incluindo bagaço de cana, engaço de bananeira e resíduos da indústria têxtil (piolho de algodão). Além disso, o objetivo geral desta proposta é caracterizar a microbiota de amostras de rúmen de caprinos e bovinos, assim como isolar novas bactérias anaeróbicas com atividade lignocelulolítica a partir destas amostras. Assim como, a caracterização de seus complexos enzimáticos e avaliação de seu potencial de utilização nas etapas de pré-hidrólise de biomassa vegetal lignocelulósica para produção de bioetanol. Tendo como perspectiva contribuir para o desenvolvimento de tecnologias competitivas de produção de bioetanol de segunda geração. Alternativamente, as bactérias selecionadas também serão avaliadas quanto à produção de amilases e lipases com a expectativa de contribuir para a melhoria do processo industrial de produção de etanol de primeira geração e de biodiesel.
  Período: 2010 - atual / Situação: EM_ANDAMENTO / Natureza: PESQUISA
• Embrapa Macroprograma 2 - Melhoramento genético da bananeira
  Embrapa Macroprograma 2 Competitividade e Sustentabilidade
  Período: 2010 - atual / Situação: EM_ANDAMENTO / Natureza: PESQUISA
• FAPDF Demanda Espontanea - Interação Musa-Mycosphaerella: Novas abordagens de seqüenciamento massal visando à identificação de genes de resistência
  Período: 2013 - atual / Situação: EM_ANDAMENTO / Natureza: PESQUISA
• CNPq Universal - Interação Musa-Meloidogyne incognita: Novas abordagens de sequenciamento massal visando à identificação de genes de resistência
  Período: 2013 - atual / Situação: EM_ANDAMENTO / Natureza: PESQUISA
• CNPq Genoprot - Estudos de sinalização celular, transcriptoma funcional e proteômica diferencial durante o processo de antagonismo do fungo Trichoderma harzianum contra Sclerotinia sclerotiorum e durante a indução de defesa e resistência em feijoeiro
  Nesta proposta a principal estratégia é utilizar ferramentas mais avançadas de proteômica diferencial e seqüenciamento Next generation sequencing para identificação de genes e proteínas envolvidos no micoparasitismo, nos mecanismos de sinalização celular da interação Trichoderma/fitopatógeno e na indução de resposta de defesa e resistência na planta hospedeira. Contribuindo com o conhecimento básico de vias de transdução de sinais em fungos e da interação patógeno/fitopatógeno e planta hospedeira. Assim como, com conhecimento que poderá ser utilizado para o desenvolvimento de novos produtos e processos biotecnológicos para o controle de doenças fúngicas em lavouras de feijão brasileiras.
  Período: 2009 - atual / Situação: EM_ANDAMENTO / Natureza: PESQUISA
• CNPq Rede EstRESCe: Projeto integrativo 2: Análise da expressão e validação de genes de resistência para controle de pragas de importância agrícola da Região Centro
  Agencia financiadora: CNPq (Edital MCT/CNPq/FNDCT/FAPs/MEC/CAPES/PRO-CENTRO-OESTE nº 31/2010)
  Período: 2010 - atual / Situação: EM_ANDAMENTO / Natureza: PESQUISA
• CNPq - FungiBrBol: rede de identificação molecular de fungos do Brasil
  CNPq (Edital MCT/CNPq/FNDCT n º 50/2010 - Identificação Molecular da Biodiversidade)
  Período: 2010 - 2014 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA
• Pronex - Interação Planta-Praga: Novas abordagens de seqüenciamento e genômica funcional visando à identificação de genes de resistência e moléculas-alvo para controle de pragas de importância agrícola.
  A agricultura é um dos principais pilares que sustentam a economia do Brasil, sendo alvo de muitos esforços no intuito de aumentar sua competitividade e rentabilidade. Entre os principais problemas relacionados à agricultura, encontram-se as perdas agrícolas devido ao ataque de insetos-praga e patógenos que comprometem em média 40% da produção mundial. Dentre as estratégias utilizadas no controle de pragas, tem-se dado especial enfoque ao desenvolvimento de plantas resistentes, obtidas tanto por melhoramento convencional quanto por transformação genética, que apresentam vantagens sobre os métodos empregados atualmente, especialmente no que se refere ao uso de agroquímicos, devido ao menor custo, maior eficiência e segurança alimentar e ambiental. No entanto, até o momento, é relativamente pequena a lista de genes de resistência já identificados em plantas e ainda menor a daqueles caracterizados e introgredidos em variedades comerciais. Assim, o entendimento mais amplo das interações planta-praga, através da análise do transcriptoma desta interação, poderá contribuir para a identificação eficiente de fatores genéticos associados à resistência não específica, estável e durável de plantas a estas pragas. Assim, propõe-se neste projeto, a análise em larga escala do transcriptoma de plantas de alta relevância econômica e social e seus respectivos patógenos de maior importância no país: arroz/Magnaporthe grisea; Banana⁄Mycosphaerella musicola; Algodão⁄bicudo-do-algodoeiro; cana-de-açúcar⁄broca gigante da cana, amendoim/Meloidogyne arenaria. Pretende-se identificar genes envolvidos nestas interações que poderão futuramente ser introduzidas em variedades comerciais, visando obtenção de plantas resistentes a estas pragas.
  Período: 2010 - 2014 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA
• Embrapa Macroprograma 2: Melhoramento genético do dendezeiro assistido por biotecnologias para aumento de produtividade, redução do crescimento e resistência ao amarelecimento fatal
  O Dendezeiro é entre as oleaginosas a de maior produtividade. O óleo é de amplo uso na indústria de alimentos, farmacêutica e química, e considerado um dos melhores óleos para produção de biodiesel. A produção brasileira ainda não atende a demanda nacional destinada principalmente para a indústria alimentícia. A cultura é indicada como uma das principais alternativas para agricultura sustentável e recuperação de áreas degradadas na Amazônia. Contudo, a expansão segura, competitiva e sustentável depende da solução de problemas limitantes à cultura, como pragas e doenças, uso inadequado de fertilizantes, restrita base genética das cultivares e necessidade do desenvolvimento e avaliação de cultivares com adaptabilidade aos ecossistemas de expansão da cultura no país. A principal ameaça, no momento, é o "Amarelecimento fatal" (AF), anomalia letal e de etiologia ainda desconhecida. Após mais de 30 anos de pesquisa a única alternativa encontrada para contornar o problema é explorar a resistência demonstrada pela espécie americana, E. oleifera, conhecida no Brasil como Caiaué que é transmitida para os híbridos interespecíficos obtidos do cruzamento com o dendê. O caiaué também apresenta resistência a outras pragas e doenças, e características de interesse para o melhoramento do dendezeiro; como reduzida taxa de crescimento do tronco e alta taxa de ácidos graxos insaturados. Por isso, o melhoramento interespecífico entre o caiaué e o dendezeiro (O x G) foi identificado como a principal prioridade do programa de melhoramento do dendezeiro desenvolvido pela Embrapa. Para redução dos custos e aumento na eficiência da avaliação e seleção dos cruzamentos ou plantas superiores pretende-se desenvolver estratégias de seleção assistida que serão formuladas a partir de informações geradas por estudos do genoma e de mapeamento de genes. Genes envolvidos em resistência a estresse biótico em dendê serão identificados neste projeto através de amplificação, seqüenciamento e análise de RGA
  Período: 2010 - 2014 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA
• CNPq - ASPECTOS EPIDEMIOLÓGICOS E MOLECULARES NO DIAGNÓSTICO E CONTROLE DA CONTAMINAÇÃO DA CASTANHA-DO-BRASIL POR AFLATOXINAS
  (Edital MCT/CNPq/MEC/CAPES/CT AGRO/CT HIDRO/FAPS/EMBRAPA Nº 22/2010). As sementes de castanha-do-brasil estão contidas em ouriços que caem das árvores no período de dezembro a junho, dependendo do local. Porém, nas regiões produtoras, que geralmente são de difícil acesso, este período corresponde a épocas de chuvas, o que favorece o atraso na coleta dos ouriços fazendo com que possa haver a contaminação das castanhas por fungos produtores de micotoxinas pelo contato prolongado com o solo. Por isso, a cadeia produtiva da castanha-dobrasil tem sido ameaçada por entraves como as dificuldades para se adequar aos padrões exigidos pelos mercados importadores, como por exemplo devido aos altos índices de aflatoxinas, uma micotoxina potencialmente cancerígena para o homem. Desta forma, o controle da contaminação por aflatoxinas é de extrema importância para a saúde pública e também com relação a perdas econômicas e ao impacto sócio-ambiental. Apesar da melhoria alcançada na qualidade do produto pelo uso de boas práticas, os problemas com contaminação por aflatoxinas não foram resolvidos. Dentre as limitações existentes no atual sistema, encontram-se as etapas críticas de secagem e armazenamento, onde a etapa de secagem primária da produção extrativa é o principal ponto crítico de sintetização da micotoxina pelos fungos. Isso acontece devido ao uso de aeração natural para a secagem, associada à condições ambientais desfavoráveis ao processo. Dessa forma, tornou-se de grande relevância a definição de novas estratégias de secagem e armazenamento de forma rápida e eficiente do ponto de vista econômico e manutenção da qualidade. Além disso, é importante que sejam realizadas mais pesquisas para definir questões como: os aspectos epidemiológicos da interação de Aspergillus spp. com sementes de castanha, bem como a identificação de possíveis métodos rápidos para detecção e quantificação de Aspergillus spp. aflatoxigênicos e de micotoxinas. Desta forma, est
  Período: 2010 - 2013 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA
• Embrapa Macroprograma 2 - INOVAÇÕES TECNOLÓGICAS PARA O CONTROLE DA CONTAMINAÇÃO DA CASTANHA-DO-BRASIL POR AFLATOXINAS
  Os ouriços da castanheira-do-brasil caem geralmente no período de janeiro a junho e são recolhidos do chão pelas populações locais. Segundo o código de práticas (CAC/RPC, 2006), o produtor pode tomar algumas precauções para evitar a contaminação da castanha, como não deixá-las junto ao solo, separar as castanhas estragadas, protegê-las da umidade, entre outras medidas. Estas práticas foram recomendadas pela Embrapa por meio do Programa de Alimentos Seguros (PAS, 2004) e pelo Codex Alimentarius (CAC/RPC, 2006). Apesar da melhoria alcançada na qualidade do produto pelo uso destas boas práticas recomendadas, os problemas com contaminação por aflatoxinas não foram resolvidos. A etapa de secagem de castanhas nas unidades de coleta (extrativista) foi identificada como o principal ponto de sintetização de micotoxinas por fungos e, conseqüentemente, de contaminação das amêndoas (BAIMA et al., 2009). Desta forma, faz-se necessário a avaliação de um sistema de secagem e armazenamento mais eficiente e com custo acessível para comunidades extrativistas e condizentes com a situação logística destas comunidades. Além disso, é importante que sejam realizadas mais pesquisas para definir questões como os aspectos epidemiológicos da interação de Aspergillus spp. com sementes de castanha, bem como a identificação de possíveis métodos rápidos para detecção e quantificação de Aspergillus spp. aflatoxigênicos e de micotoxinas e um estudo da cadeia produtiva de vários Estados produtores de castanha-do-brasil no que se relaciona à contaminação por aflatoxina. Paralelamente, existe a necessidade de desenvolver metodologias cada vez mais rápidas, sensíveis e específicas para a detecção e quantificação de aflatoxinas, para que produtos exportados possam atender às exigências internacionais cujos limites máximos, estabelecidos pelo regulamento 2001/466 da Comunidade Européia, são de 4 ppb sendo 2 ppb para aflatoxina B1.
  Período: 2009 - 2012 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA
• FINEP - MUSAGENEBR2 - projeto 0842/07 - Projeto: Descoberta de Genes de Resistência na Interação entre Musa Acuminata e Mycosphaerella fiijensis
  O Brasil é atualmente o segundo maior produtor de Musa, contribuindo para aproximadamente 10% da produção mundial. Musa é considerada uma lavoura perene e importante para o pais, facil de cultivar durante todo o ano, inclusive por pequenos produtores em solos e climas diferentes, além de contribuir para manter a fertilidade do solo. Como um component de uma dieta básica em muitos paises produtores, a maioria do producao no Brasil e direcionada para o mercado interno, onde Musa representa um componente importante da dieta de comunidades mais pobres, oferecendo uma fonte barata de vitaminas A, C, e B6, alem de calcio, potássio, e enxofre. Banana é produzida em todo o país, com principais estados produtores sendo: São Paulo (1.151.600 toneladas), Bahia (763.901 toneladas), Pará (723.694 toneladas), Santa Catarina (628.850 toneladas) e Minas Gerais (607.575 toneladas). O cultivo da bananeira no Brasil é afetado por problemas fitossanitários causados por fungos, bactérias, vírus, nematóides e insetos, com a maioria de variedades comerciais não apresentando resistência a doenças. As doencas fungicas de maior importância para a bananicultura brasileira, são o Mal-do-Panamá (causado por Fusarium oxysporum f.sp. cubense), a Sigatoka amarela (causado por Mycosphaerella musicola) e Sigatoka negra (causado por Mycosphaerella fijiensis). O projeto tem como objetivo geral realizar a descoberta de genes em Musa acuminata, em integração com o patogeno Mycosphaerella fijiensis, agente causador de Sigatoka Negra Como objetivos específicos: 1. A partir dos dados gerados nos projetos anteriores, pretende-se realizar a varredura virtual de genes de vias de sinalização e subsidiar e execução de atividades moleculares avançadas com ênfase na validação dos dados in silico 2. O projeto pretende identificar marcadores moleculares validados para fins de desenvolvimento de mapas genéticos de Musa 3. Realizar a identificação de novos análogos a genes de resistência em Musa
  Período: 2007 - 2012 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA
• FINEP - Dinamização do banco ativo de germoplasma de dendê (Elaies guineensis) da Embrapa e apoio ao melhoramento genético
  O projeto tem como objetivos principais: i) obter cultivares de dendezeiro com alta produtividade, resistentes ao amarelecimento fatal (AF) e com reduzido crescimento vertical do caule pelo emprego de métodos convencionais e biotecnológicos; ii) Definir protocolos para propagação clonal em larga escala de genótipos elite e genitores, selecionados no programa de melhoramento genético, para incorporação ao sistema produtivo nacional; iii) Produzir um mapa físico de dendê e caiauê baseados em clones de Bacterial Artificial Chromosomes (BACs), que servirão para orientação e complementação de programas de melhoramento assistido por marcadores moleculares, além de propiciar um ganho no conhecimento genético e na genômica estrutural da espécie; iv) Identificar e caracterizar componentes genéticos de resistência a estresses bióticos e marcadores gênicos funcionais para mapeamento genético a ser utilizado em programas de melhoramento de dendê e caiauê; v) Uso da metagenômica como estratégia para identificação do agente causal do amarelecimento fatal (AF); vi) Desenvolver sistema referência de transformação genética de genótipos de dendezeiro para incorporação de genes de resistência para a cultura e vii) apoio a dinamização do banco ativo de germoplasma de dendê. O desenvolvimento de tecnologias a partir dos resultados obtidos neste projeto manterá o Brasil em posição de destaque dentro da Rede Brasileira de Tecnologia de Biodiesel (RBTB). Além disso, este projeto gerará produtos que deverão beneficiar diretamente a indústria e os sistemas de produção associado ao setor. Este projeto está sendo desenvolvido por uma rede de pesquisa de abrangência nacional, constituída por seis Centros de Pesquisa da Embrapa, quatro Universidades, três Institutos de Pesquisa, envolvendo cerca de 50 pesquisadores.
  Período: 2009 - 2011 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA
• Embrapa Macroprograma 2 - Identificação, caracterização e mapeamento físico de alta resolução de clones de BAC contendo seqüências gênicas relacionadas a estresses bióticos, abióticos e seqüências promotoras em cromossomos de Musa spp.
  Devido à grande complexidade genética existente dentro do gênero Musa, pouca informação está disponível, principalmente em nível cromossômico e de DNA. O mapeamento físico de cromossomos e seus genes por meio de técnicas citogenéticas é uma ferramenta útil para os trabalhos de melhoramento genético e de transformação de plantas. Em geral, estratégias de mapeamento físico geram subsídios que permitem, entre outros, correlacionar marcadores moleculares a cromossomos específicos e suas regiões, integrar mapas físicos e mapas de ligação gênica, identificar cromossomos por meio de DNA marcador e, por fim, diferenciar cromatina parental em híbridos inter-específicos e suas progênies. Alguns trabalhos desenvolvidos recentemente têm indicado que estudos de cromossomos de alta resolução são possíveis até mesmo em espécies com cromossomos pequenos como Musa e que citogenética molecular pode ser usada para localizar fisicamente seqüências de DNA de interesse. O projeto de pesquisa, propõe-se realizar o mapeamento físico em larga escala de clones de BAC contendo seqüências gênicas relacionadas a estresses bióticos, abióticos e de seqüências promotoras em cromossomos banana e, a partir deste mapeamento, gerar um mapa físico citogenético para Musa acuminata. Para tanto, será utilizada a técnica de "High Resolution FISH" que permite o mapeamento de alta resolução de clones de BAC em cromossomos em fase de paquíteno (pouco condensados) obtidos de células meióticas coletadas de anteras de flores masculinas de banana.
  Período: 2009 - 2011 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA
• IAEA - GENE DISCOVERY AND FUNCTIONAL MARKER DEVELOPMENT IN THE MUSA ACUMINATA CALCUTTA 4 V MYCOSPHAERELLA FIJIENSIS PLANT PATHOGEN INTERACTION (Financiamento do IAEA)
  Commercial banana varieties (Musa spp.) are cultivated in over 120 countries, generating an annual global production of nearly 100 million tons. Brazil currently produces approximately 9.5% of world production, and represents after India the second largest producer world-wide, with a production area in excess of 500 thousand hectares and an annual production of 6.5 million tons. Although ranked as the fourth most important food commodity in terms of gross value of production after rice, wheat and maize, less attention has been given to the genetic improvement of bananas and plantains in comparison to other major food crops. Almost all cultivated bananas are difficult to breed because they are seedless and sterile, and as a consequence genetic diversity of commercial banana varieties is low, such that sources of resistance to important diseases are frequently lacking. In 1998, the fungal pathogen Mycosphaerella fijiensis, causal organism of black leaf streak disease (BLSD), which causes premature fruit ripening, necrotic leaf surfaces lesions, leading to leaf area decomposition and yield losses of up to 50%, was reported for the first time in Brazil in the Amazon region, and has since spread across the majority of the country. Genomics resources offer the potential for new control strategies for this disease, and for support to breeding programmes. Within this project, resistance genes to M. fijiensis will be identified through an EST and RGA approach, and gene based simple sequence repeat (SSR), single nucleotide polymorphism (SNP), and EST and RGA functional markers will be developed and evaluated on Musa parentals for resistance to BLSD, for subsequent use in genetic map constructions in Musa. The Unigene set identified will serve for subsequent uptake in Musa DNA macro-array developmentsThis international project represents a continuation of the ongoing research line at UCB within the INIBAP International Musa Genomics Consortium initiative. Collaborative institu
  Período: 2005 - 2010 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA
• FAPDF - Desenvolvimento de kits diagnosticas para o detecção de aflatoxinas, visando a segurança alimentar (Financiamento do FAPDF, Edital PAPPE)
  A contaminação de alimentos e seus derivados por fungos produtores de micotoxinas como aflatoxinas pode causar sérios danos a saúde animal e humana, podendo induzir efeitos teratogênicos, imunosupressivos, nefrotóxicos, tumorogênicos, hepatóxicos e carcinogênicos. Apesar de substancial avanço na área de analise de micotoxinas por cromatográfica no brasil, com a implantação do laboratório de controle de qualidade e segurança alimentar do MAPA, faz-se necessário a disponibilização de ferramentas analíticas que propiciem a redução de custos de análise, e que possibilitem a avaliação da ocorrência de fungos micotoxigenicos já no início das cadeias produtivas, possibilitando o controle e a redução dos níveis de contaminação e a implantação dos sistemas de qualidade. Além disso, a falta de um método acessível de certificação rotineira dos produtos para consumo interno, aumenta o risco de exposição da população a estas toxinas, tanto em produtos para alimentação humana como animal. Este projeto visa desenvolver métodos moleculares precisos e rápidos de detecção de fungos produtores de aflatoxinas, visando a melhoria da qualidade de amendoim, castanha-do-brasil, e milho para consumo interno e exportação. Atraves de identificação de seqüências especificas para as espécies aflatoxigenicos e dos genes candidatos das vias biossinteticas, primers para fungos produtores de aflatoxinas serão desenvolvidos para sua utilização em PCR múltiplo, visando sua detecção simultânea em amêndoas contaminadas. Espera-se que esta metodologia, adaptado na forma de kit diagnostico, por ser mais rápida e barata, possibilite análises mais freqüentes, em rotina de certificação, facilitando a determinação de focos de contaminação no campo, transporte e armazéns. Este kit diagnóstico ira contribuir para o aumento da qualidade dessas grãos, a diminuição da freqüência de contaminação dos lotes, a redução dos riscos à saúde humana e animal e o aumento do valor de exportação destes produtos.
  Período: 2005 - 2009 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA
• UCB SIGEP - Busca de genes e desenvolvimento de marcadores funcionais na interação Musa acuminata Calcutta 4 v Mycosphaerella fijiensis (MUSAMARKER) (Financiamento UCB SIGEP)
  Período: 2005 - 2007 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA
• PRODETAB 003 -01/01: Desenvolvimento de PCR múltiplo para o diagnóstico molecular de fungos produtores de micotoxinas em castanha de caju e castanha-do-Brasil
  A cultura do cajueiro gera 200 milhões de dólares anualmente no Brasil. Alguns fungos contaminantes são produtores de micotoxinas, que causam danos a saúde animal e humana, e perdas de até 50% das exportações. A maior parte da produção anual de 20.000 toneladas de castanha-do-Brasil é exportada, e níveis de aflatoxinas superiores a 2,25 ppm tem sido observados. Estes altos níveis de contaminação dificultam as exportações destes produtos. As análises conduzidas para a detecção de micotoxinas são através de HPLC e TLC, as quais detectam a micotoxina ao invés do agente causal. Análises antes da exportação podem ser negativas quanto à presença de micotoxinas, apresentando resultados positivos quando o carregamento atinge o destino final, acarretando prejuízos aos exportadores. Isto ocorre porque durante o transporte, sob condições favoráveis, o fungo que já contaminava as amostras passa a produzir as toxinas. Este projeto visa desenvolver um método molecular de detecção de fungos produtores de micotoxinas, visando a melhoria da qualidade dessas amêndoas para consumo interno e exportação. Primers para produtores de micotoxinas serão desenvolvidos para sua utilização em PCR múltiplo, visando sua detecção simultânea em amêndoas contaminadas. Espera-se que este método, por ser mais rápido e barato, possibilite uma análise mais freqüente, em rotina de certificação, possibilitando a determinação de focos de contaminação no campo, transporte e armazéns. O diagnóstico irá contribuir para o aumento da qualidade dessas amêndoas, a diminuição da freqüência de contaminação dos lotes, redução dos riscos a saúde humana e animal e aumento do valor de exportação do produto. Collaborative institutions within this current project comprise UCB (Brazil) and Embrapa (Brazil).
  Período: 2002 - 2007 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA
• CNPq - Desenvolvimento De Kits Diagnosticos Para Deteccao De Aflatoxinas Em Graos Brasileiros (Financiamento pelo CNPq - Programa Rhae)
  Support funding for 2 technicians (Rhae DTI and RHAE ITI) active in research activities in research projects focussing on development of diagnostic kits for mycotoxigenic fungi
  Período: 2005 - 2007 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA
• CNPq - MusaGeneBR - Identificação e caracterização funcional de genes de resistência a estresses bióticos e seqüência promotora de expressão gênica em banana (Musa spp.) (Financiamento do CNPq)
  Como resultado da realização do projeto Análise da estrutura primária do genoma A de Musa acuminata , foi criado na Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia o DATA_Musa, um banco de dados de seqüências de DNA de banana. O DATA_Musa contará no final de 2004 com as seqüências consenso de cinco clones da biblioteca de BAC de M. acuminata ssp. burmannicoides, variedade Calcutta 4 (AA), que juntas cobrem aproximadamente 525 kb de DNA de banana, e contém 127 ORFs; além de aproximadamente 2.000 seqüências potenciais de análogos de genes de resistência (RGAs) obtidas de fragmentos de DNA, amplificados por PCR utilizando primers degenerados desenhados a partir de motivos conservados presentes em domínios de genes de resistência conhecidos, tais como NBS nucleotide binding site e LRR-leucine rich repeat. Juntar-se-ão a essas seqüências, no final de 2004, entre 15 e 20 mil seqüências de Expressed Sequence Tags (ESTs) geradas a partir de sete bibliotecas de cDNA de banana (casca, raiz, flor masculina, folha, etc.). O DATA_Musa, hoje o segundo maior banco de dados de seqüências de banana no mundo, será o ponto de partida para o projeto aqui proposto. A exploração do DATA_Musa permitirá disponibilizar seqüências de DNA que irão permitir, não só a busca por seqüências de DNA de banana com uso potencial no agronegócio brasileiro (tais como: genes de resistência e seqüências promotoras de expressão), como também viabilizarão a produção de ferramentas de análise de função gênica (tais como: macro-arranjo de DNA de banana e plantas transgênicas superexpressando genes candidatos de resistência a fungos). Além disso, a exploração do DATA_Musa ajudará a criar um banco de marcadores moleculares funcionais de banana, que serão utilizados em trabalhos de geração de mapa genético de banana, que poderão permitir a identificação de marcadores ligados a genes de resistência a estresses bióticos e sua subseqüente aplicação em programa de seleção assistida com marcadores, uma antiga demanda
  Período: 2005 - 2007 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA
• Embrapa Macroprograma 2, Competitividade e Sustentabilidade Setorial: Melhoramento Genético da Bananeira
  Projeto com os objetivos de buscar genes de resistencia a Sigatoka negra em banana, atraves de analise de ESTs, RGAs e microsintenia entre Musa acuminata cv Calcutta 4 e Oryza sativa This project represents one of the ongoing research projects within the INIBAP International Musa Genomics Consortium initiative. Research activities comprise sequencing of BAC clones, ESTs and RGAs in Musa acuminata cv Calcutta 4. Collaborative institutions within this current project comprise UCB (Brazil), Embrapa (Brazil), CIRAD (France) and The Institute for Genomics Research (TIGR) (USA).
  Período: 2003 - 2006 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA
• CNPq 48.0479/01-1 / 680.398/01-5: Análise da Estrutura Primária do Genoma A de Musa acuminata
  Projeto com os objetivos de buscar genes de resistencia a Sigatoka negra em banana, atraves de analise de ESTs, RGAs e microsintenia entre Musa acuminata cv Calcutta 4 e Oryza sativa This project represents one of the ongoing research projects within the INIBAP International Musa Genomics Consortium initiative. Research activities comprise sequencing of BAC clones, ESTs and RGAs in Musa acuminata cv Calcutta 4. Collaborative institutions within this current project comprise UCB (Brazil), Embrapa (Brazil), CIRAD (France) and The Institute for Genomics Research (TIGR) (USA).
  Período: 2002 - 2005 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA
• UCB SIGEP - Desenvolvimento de sistemas de PCR múltiplo para o diagnóstico molecular de fungos produtores de aflatoxinas e ocratoxinas em grãos brasileiros (Financiamento pela UCB, Edital SIGEP)
  Objetivos Gerais Melhoria da qualidade de amendoim, castanha-do-brasil, milho e cafe para consumo interno e exportação através do desenvolvimento de métodos moleculares de detecção de fungos produtores de aflatoxinas e ocratoxinas, para uso em programas de certificação. Objetivos Específicos Caracterização molecular de populações representantes dos organismos produtores de aflatoxinas em amendoim, castanha-do-brasil, e milho no Brasil em nível especifico e intraespecifico. Caracterização molecular de populações representantes dos organismos produtores de ocratoxinas em café em nível especifico e intraespecifico. Desenvolvimento de primers específicos para PCR múltiplo visando a detecção dos principais fungos produtores de aflatoxinas e ocratoxinas em amendoim, castanha-do-brasil, milho e café. Utilização dos primers de PCR múltiplo desenvolvidos na triagem, identificando possíveis focos de contaminação por fungos produtores de micotoxinas no campo, meio de transporte e locais de armazenagem. This project focuses on the molecular characterization of ochratoxigenic and aflatoxigenic fungi and development of molecular diagnostic methods based upon multiplex PCR for rapid and sensitive detection in contaminated grain material (coffee beans, Brazil nut, peanut, maize). Collaborative institutions within this project comprise UCB (Brazil) and Embrapa (Brazil).
  Período: 2004 - 2005 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA
• Caracterizacao molecular de isolados de Verticillium dahliae patogenico em oliveira na Argentina
  Treinamento de aluno de dotourado em caracterizacao molecular de isolados de Verticillium dahliae patogenico em oliveira na Argentina (atraves de analise de rDNA genomica por PCR RFLP e sequenciamento)
  Período: 2000 - 2004 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA
• UCB SIGEP - Caracterização molecular de isolados de Fusarium solani patogênicos a batata e soja no Brasil e desenvolvimento de métodos diagnósticos para detecção e identificação em plantas e sementes
  Os objetivos: Determinacao da variabilidade genetica entre populacoes de F. solani causadores de olho preto em batata e morte subita em soja, e desenvolvimento de sistemas de diagnose molecular The objectives of this project (SIGEP) were to characterize at the molecular level the phytopathogenic fungi Fusarium solani f. sp. glycines and Fusarium solani / Fusarium eumartii. Clarification of the taxa and determination of variability in relation to geographic origin and pathogenicity were conducted using rDNA and RAPD molecular markers. Specific primers for molecular detection were developed. Collaborative institutions within this project comprise UCB (Brazil), Embrapa (Brazil) and the Universidade de Brasilia.
  Período: 2000 - 2002 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA
• Caracterizacao molecular de populacoes de Crinipellis sp. de cacao e outros hospedeiros no Brasil
  Determinacao da variabilidade de populacoes de Crinipellis perniciosa de T. cacao e outros hospedeiros no Brasil, e desenvolvimento de um sistema de diagnose molecular
  Período: 1999 - 2000 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA
• PRODETAB (Coordenador subprojeto 2): Projeto Número: 106-01/98 - Caracterização de isolados de Fusarium solani patogênicos a batata e soja no Brasil e desenvolvimento de métodos para diagnóstico em plantas e sementes
  Fusarium spp., especialmente patótipos relacionados com F. solani são responsáveis por perdas significativas em soja e batata, culturas importantes para o Brasil. Maiores perdas são relacionadas com olho-preto em batata e sindrome da morte súbita - SDS em soja. O gênero Fusarium é conhecido pela variabilidade morfológica e cultural, e também pela da dependência de fatores ambientais para o desenvolvimento de doenças, dificultando a identificação precisa do agente causal. Estudos no nível molecular (marcadores genéticos) podem agilizar a discriminação dos grupos de Fusarium patogênicos a batata e soja. Em soja, após o registro da SDS no país (1996), o quadro das podridões radiculares tornou-se bastante complexo, com drástica elevação das perdas por podridão radicular. Embora formalmente designado por Fusarium solani f.sp. glycines, a identidade e a delimitação dos Fusarium associados à SDS ainda suscita controvérsia científica. Em batata, várias espécies de Fusarium causam a podridão-seca, com perdas significativas em batata-semente durante o armazenamento e no campo. A constatação do olho-preto no país (1993), também relacionada com F. solani, aumenta a preocupação quanto à batata-semente, que é o principal veículo de transmissão do patógeno. Métodos científicos de diagnose do olho-preto não são usados, pois pouco se conhece sobre o patógeno e a doença. O projeto visa a identificação acurada das espécies envolvidas (a) nas doenças podridão-seca e olho-preto da batata, e (b) podridões radiculares de soja, especialmente a SDS. Inclui o desenvolvimento de métodos simples e sensíveis para detecção dos patógenos em material vegetal infectado. Específicamente, pretende-se estabelecer a relação entre os taxa causadores da SDS e do olho preto e os demais Fusarium associados à soja e batata. Os estudos possibilitarão fazer inferências quanto à origem, distribuição, mecanismos de sobrevivência e disseminação destes patógenos, orientando as medidas de controle. O dese
  Período: 1999 - 2000 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA
• CNPq - Caracterizacao molecular de Fusarium spp. em batata no Brasil
  Clarificacao da identidade do organismo causador de olho preto em batata, e desenvolvimento de um sistema de diagnose molecular para deteccao em batata semente (bolsa de pesquisador visitante, CNPq 1997 - 1999).
  Período: 1997 - 1999 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA
• UK ODA/DFID - Molecular Characterization of Ganoderma populations at the vegetative stage (Apoio financeiro UK Overseas Development Administration)
  Projeto Internacional para clarificacao da identidade do organismo causador de basal stem rot em dende, e desenvolvimento de um sistema de diagnose molecular. Financiamento pelo UK Overseas Development Administration (ODA) (hoje DFID), e instituicoes em coleboracao: CABI Bioscience UK centre (Egham) and Universiti Putra Malaysia (UPM)
  Período: 1991 - 1997 / Situação: CONCLUIDO / Natureza: PESQUISA

Áreas de Atuação

• Ciências Agrárias :: Agronomia :: ::
• Ciências Agrárias :: Agronomia :: Fitossanidade :: Fitopatologia
• Ciências Biológicas :: Bioquímica :: Biologia Molecular ::
• Ciências Biológicas :: Genética :: Genética Molecular e de Microorganismos ::
• Ciências Biológicas :: Genética :: Genoma ::
• Ciências Biológicas :: Microbiologia :: ::

Idiomas

• Francês: Lê: RAZOAVELMENTE, Fala: RAZOAVELMENTE, Escreve: RAZOAVELMENTE, Compreende: RAZOAVELMENTE
• Inglês: Lê: BEM, Fala: BEM, Escreve: BEM, Compreende: BEM
• Português: Lê: BEM, Fala: BEM, Escreve: BEM, Compreende: BEM

Banca Julgadora

Eventos

Orientação

Produção Bibliográfica

Produção Técnica