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Detalhes da Produção
Tipo | Artigo Publicado |
Grupo | Produção Bibliográfica |
Descrição | PROSDOCIMI, Francisco ; Carvalho, Daniel Cardoso ; Almeida, Renan Nascimento ; Beheregaray, Luciano B.. The complete mitochondrial genome of two recently derived species of the fish genus Nannoperca (Perciformes, Percichthyidae). Molecular Biology Reports, v. , p. veja doi-, 2011. |
Autor | Francisco Prosdocimi |
Ano | 2011 |
Informações Complementares
Ano do artigo | 2011 |
Descricão e Informacões Adicionais | Neste trabalho montamos e anotamos as mitocôndrias completas de dois peixes do gênero `Nannoperca`. Estas foram os primeiros genomas mitocondriais conhecidos para a família Percichthyidae. Para um dos peixes (`N. obscura`), o mitogenoma foi montado inteiro a partir de reads geradas em sequenciamento de nova geração (454 ou pirosequenciamento). Para a outra espécie de `Nannoperca` (`N. australis`), o sequenciamento apenas não foi capaz de produzir a versão completa da mitocôndria. Assim realizamos um procedimento de "genome finishing", onde criamos primers para um PCR da região faltante baseado no genoma de `N. obscura`. As montagens foram realizadas com o software MIRA. A montagem do mitogenoma de `N. obscura` foi feita a partir das reads originais de pirosequenciamento, enquanto o mitogenoma de `N. australis` foi montado a partir de um assembly misto, contendo sequências geradas em máquinas 454 e sequenciamento Sanger -- usando ainda o mitogenoma da primeira espécie como referência. Os mitogenomas produzidos foram totalmente anotados, sendo que encontramos neles as características comuns presentes em mitocôndrias de vertebrados. De forma interessante, notamos bastante semelhança entre os dois mitogenomas, o que indica especiação recente (Pleistoceno) entre as duas espécies do gênero. |
Divulgacão Científica | NAO |
DOI | 10.1007/s11033-011-1034-5 |
Homepage do Trabalho | [http://www.springerlink.com/content/e08784687346823l/][doi:10.1007/s11033-011-1034-5] |
Idioma | Inglês |
ISSN | 03014851 |
Meio de Divulgação | MEIO_DIGITAL |
Natureza | COMPLETO |
Página Inicial | veja doi |
Relevância | NAO |
Título do Artigo | The complete mitochondrial genome of two recently derived species of the fish genus Nannoperca (Perciformes, Percichthyidae) |
Título do Artigo(en) | The complete mitochondrial genome of two recently derived species of the fish genus Nannoperca (Perciformes, Percichthyidae) |
Título do Períodico ou Revista | Molecular Biology Reports |